Protein–RNA interactions for Protein: P62915

Gtf2b, Transcription initiation factor IIB, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2bP62915 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gtf2bP62915 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gtf2bP62915 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms