Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Rpl30P62889 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rpl30P62889 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms