Protein–RNA interactions for Protein: P62748

Hpcal1, Hippocalcin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpcal1P62748 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Hpcal1P62748 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Hpcal1P62748 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms