Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Acta2P62737 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acta2P62737 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Acta2P62737 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Acta2P62737 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms