Protein–RNA interactions for Protein: P62305

Snrpe, Small nuclear ribonucleoprotein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpeP62305 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SnrpeP62305 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SnrpeP62305 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms