Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lmo4P61969 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Lmo4P61969 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.7 ms