Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vbp1P61759 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Vbp1P61759 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Vbp1P61759 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms