Protein–RNA interactions for Protein: P61750

Arf4, ADP-ribosylation factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf4P61750 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf4P61750 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf4P61750 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Arf4P61750 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Arf4P61750 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arf4P61750 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arf4P61750 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Arf4P61750 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Arf4P61750 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Arf4P61750 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Arf4P61750 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Arf4P61750 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf4P61750 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf4P61750 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf4P61750 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf4P61750 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Arf4P61750 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Arf4P61750 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Arf4P61750 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arf4P61750 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Arf4P61750 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms