Protein–RNA interactions for Protein: P61588

Rnd3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnd3P61588 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rnd3P61588 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Rnd3P61588 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms