Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smg6P61406 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Smg6P61406 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smg6P61406 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Smg6P61406 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg6P61406 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg6P61406 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Smg6P61406 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Smg6P61406 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Smg6P61406 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms