Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ube2kP61087 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ube2kP61087 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms