Protein–RNA interactions for Protein: P61021

Rab5b, Ras-related protein Rab-5B, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5bP61021 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab5bP61021 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab5bP61021 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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