Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ActbP60710 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ActbP60710 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ActbP60710 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ActbP60710 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ActbP60710 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ActbP60710 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ActbP60710 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ActbP60710 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ActbP60710 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ActbP60710 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ActbP60710 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ActbP60710 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ActbP60710 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ActbP60710 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ActbP60710 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ActbP60710 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ActbP60710 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms