Protein–RNA interactions for Protein: P60335

Pcbp1, Poly(rC)-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcbp1P60335 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Pcbp1P60335 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Pcbp1P60335 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Pcbp1P60335 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms