Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rims4P60191 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Rims4P60191 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Rims4P60191 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms