Protein–RNA interactions for Protein: P59913

Pcmtd1, Protein-L-isoaspartate O-methyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcmtd1P59913 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcmtd1P59913 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcmtd1P59913 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcmtd1P59913 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms