Protein–RNA interactions for Protein: P59708

Sf3b6, Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6P59708 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Sf3b6P59708 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Sf3b6P59708 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sf3b6P59708 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms