Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Hps5P59438 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Hps5P59438 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms