Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Nphp4P59240 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nphp4P59240 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms