Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scarf2P59222 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Scarf2P59222 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scarf2P59222 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scarf2P59222 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf2P59222 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf2P59222 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf2P59222 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf2P59222 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf2P59222 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scarf2P59222 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scarf2P59222 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf2P59222 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf2P59222 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf2P59222 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf2P59222 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf2P59222 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf2P59222 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scarf2P59222 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf2P59222 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf2P59222 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf2P59222 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf2P59222 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf2P59222 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf2P59222 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Scarf2P59222 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scarf2P59222 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scarf2P59222 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Scarf2P59222 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms