Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Pdrg1P59048 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Pdrg1P59048 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
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