Protein–RNA interactions for Protein: P58749

Tm6sf1, Transmembrane 6 superfamily member 1, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm6sf1P58749 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tm6sf1P58749 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tm6sf1P58749 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms