Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P58686 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P58686 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P58686 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
P58686 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P58686 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P58686 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P58686 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P58686 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P58686 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P58686 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P58686 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
P58686 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
P58686 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
P58686 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
P58686 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms