Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Paxbp1P58501 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Paxbp1P58501 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Paxbp1P58501 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms