Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PtpaP58389 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpaP58389 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpaP58389 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpaP58389 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PtpaP58389 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PtpaP58389 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms