Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp25P57080 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp25P57080 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp25P57080 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp25P57080 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms