Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bace1P56818 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bace1P56818 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Bace1P56818 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Bace1P56818 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Bace1P56818 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms