Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp5P56399 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Usp5P56399 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Usp5P56399 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp5P56399 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Usp5P56399 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms