Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sh3bp1P55194 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp1P55194 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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