Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Abcd3P55096 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Abcd3P55096 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms