Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GemP55041 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GemP55041 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GemP55041 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GemP55041 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GemP55041 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
GemP55041 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GemP55041 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GemP55041 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
GemP55041 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GemP55041 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GemP55041 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GemP55041 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GemP55041 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
GemP55041 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
GemP55041 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GemP55041 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GemP55041 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GemP55041 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GemP55041 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GemP55041 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GemP55041 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GemP55041 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GemP55041 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GemP55041 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
GemP55041 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GemP55041 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
GemP55041 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms