Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Acod1P54987 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Acod1P54987 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acod1P54987 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms