Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cacnb3P54285 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cacnb3P54285 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cacnb3P54285 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms