Protein–RNA interactions for Protein: P53349

Map3k1, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k1P53349 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Map3k1P53349 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC31.45■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Map3k1P53349 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Map3k1P53349 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Map3k1P53349 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms