Protein–RNA interactions for Protein: P51491

Opn1sw, Short-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1swP51491 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Opn1swP51491 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Opn1swP51491 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms