Protein–RNA interactions for Protein: P50715

Defa-rs7, Alpha-defensin-related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs7P50715 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Defa-rs7P50715 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Defa-rs7P50715 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms