Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defa6P50704 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defa6P50704 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defa6P50704 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms