Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SftpdP50404 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SftpdP50404 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SftpdP50404 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms