Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxcl5P50228 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxcl5P50228 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms