Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CtshP49935 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CtshP49935 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CtshP49935 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtshP49935 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CtshP49935 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CtshP49935 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtshP49935 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtshP49935 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtshP49935 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CtshP49935 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtshP49935 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtshP49935 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtshP49935 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtshP49935 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtshP49935 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtshP49935 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CtshP49935 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CtshP49935 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtshP49935 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtshP49935 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtshP49935 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtshP49935 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtshP49935 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtshP49935 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CtshP49935 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtshP49935 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CtshP49935 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtshP49935 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtshP49935 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtshP49935 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CtshP49935 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtshP49935 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtshP49935 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtshP49935 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtshP49935 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtshP49935 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtshP49935 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CtshP49935 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CtshP49935 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CtshP49935 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtshP49935 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CtshP49935 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtshP49935 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtshP49935 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtshP49935 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtshP49935 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CtshP49935 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtshP49935 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtshP49935 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtshP49935 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CtshP49935 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtshP49935 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtshP49935 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CtshP49935 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CtshP49935 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms