Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cav1P49817 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Cav1P49817 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cav1P49817 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cav1P49817 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms