Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VegfbP49766 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VegfbP49766 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
VegfbP49766 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms