Protein–RNA interactions for Protein: P49615

Cdk5, Cyclin-dependent-like kinase 5, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5P49615 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cdk5P49615 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Cdk5P49615 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cdk5P49615 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms