Protein–RNA interactions for Protein: P49003

Bmp5, Bone morphogenetic protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp5P49003 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Bmp5P49003 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Bmp5P49003 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms