Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tnni3P48787 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tnni3P48787 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms