Protein–RNA interactions for Protein: P48759

Ptx3, Pentraxin-related protein PTX3, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx3P48759 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ptx3P48759 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ptx3P48759 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms