Protein–RNA interactions for Protein: P48754

Brca1, Breast cancer type 1 susceptibility protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca1P48754 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca1P48754 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Brca1P48754 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca1P48754 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brca1P48754 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brca1P48754 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brca1P48754 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms