Protein–RNA interactions for Protein: P48298

Ccl11, Eotaxin, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl11P48298 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccl11P48298 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccl11P48298 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms