Protein–RNA interactions for Protein: P47963

Rpl13, 60S ribosomal protein L13, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13P47963 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl13P47963 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl13P47963 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms