Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Rpl5P47962 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rpl5P47962 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Rpl5P47962 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms